Chloé Leveque
Stagiaire En Bioinformatique @Ciml
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WORK HISTORY
Stagiaire En Bioinformatique @Ciml
Marseille, FR
Durant ce stage de M2, je travaille sur le benchmarking de pipelines d’analyses de criblages CRISPR combinés à la transcriptomique à l’échelle de la cellule unique (scRNA-seq), dans le but d’évaluer et comparer différentes approches bioinformatiques existantes.Mon travail consiste à analyser, implémenter et comparer des pipelines d’analyse single-cell, notamment pour l’identification et l’interprétation des effets des perturbations génétiques, en mettant l’accent sur la robustesse, la reproductibilité et les performances des méthodes.Les analyses sont réalisées principalement en R, dans des environnements Docker sous Linux, avec une attention particulière portée à la structuration des workflows et à la reproductibilité des analyses.Les pipelines et outils utilisés pourront évoluer au cours du stage en fonction des besoins du projet.Stage réalisé au sein de l’équipe de Madame Roulland, CIML,Encadrée par Madame Soun, bioinformaticienne de l’équipe.
EDUCATION
Université Claude Bernard Lyon 1
Licence professionnelle Bio-Industries et Biotechnologies parcours Génomique, Science des gènes / génomique
Faculté des Sciences Aix-Marseille Université
Master, Biologie structurale, génomique
Lycée Jacques Coeur
Baccalauréat STL option Biotechnologies, Science de laboratoire clinique / technologie / technologue médical
Collège Edouard Vaillant
Brevet des collèges , Études générales
lycée André paillot
BTSA anabiotec, Biotechnologie
ABOUT CHLOÉ LEVEQUE
Après deux années d’expérience en tant que technicienne de recherche, j’ai intégré le Master BSG parcours Génomique et analyses des données en Bioinformatique d’Aix-Marseille Université afin de développer une expertise en analyse de données biologiques à haut débit.Mon stage de M1 au CRCM a constitué ma première immersion en bioinformatique, à travers l’analyse de données de single-cell RNA-seq. Cette expérience m’a permis de mieux appréhender les enjeux de l’analyse à grande échelle et de m’intéresser aux aspects méthodologiques et techniques des analyses.Actuellement en M2, j’ai intégré le CIML pour un stage de six mois portant sur le benchmarking de pipelines d’analyse de criblages CRISPR couplés au single-cell. Ce projet me permet d’approfondir ma compréhension des workflows bioinformatiques, de la comparaison de méthodes et des choix méthodologiques associés.Ces expériences contribuent aujourd’hui à affiner mon intérêt pour la bioinformatique, notamment autour des aspects méthodologiques et du développement.
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